学校创办于1948年，经过60多年的办学锤炼，积累了丰富的职业教育办学经验，办学水平和人才培养质量得到社会的广泛认可。重庆医药高等专科学校是一所具有光荣革命传统的学校，具有60多年的办学历史。 1995 年，在全国率先创办五年制药剂、医学检验专业高职教育，先后与重庆医科大学、重庆职工医学院等高校联办高等医学教育，培养了近十万名大、中专医药卫生专业人才，为人民卫生事业做出了突出贡献。曾荣获全国卫生系统先进单位、全国五四红旗团委、重庆市职业技术教育先进集体、重庆市先进基层党组织、重庆市文明单位、重庆市依法治校示范学校、重庆市大中专毕业生就业工作先进集体、重庆市招生工作先进集体等殊荣。现为重庆市卫生局卫生人才培训基地、重庆市农村卫生人员培训中心、重庆市出国卫生人员培训基地，北京大学医学网络学院重庆学习中心。

        重庆医药高等专科学校将传承半个世纪的优良传统，肩负3000 万人民的健康事业，以先进的办学，优良的环境、良好的办学条件、突出的专业特色为目标，把学校建成“国内一流、西部领先”的高等医药专科学校， 为人民健康事业的发展，为西部经济的腾飞，谱写更加辉煌的篇章。学校秉承“以生为本，立德树人”的办学理念，弘扬“笃学求真，懿德善能”的校训，倡导“弘德善教，爱生律己”的优良校风和“修德勤学，尊师守纪”的学风，紧贴重庆和西部地区基层医疗卫生事业、药品生产经营行业、健康相关产业发展需求，培养医药卫生行业高素质技能型专门人才，重点办好普通专科教育，积极开办继续教育，努力把学校建设成为以药学、护理、医学技术、临床医学等专业为主体，质量、规模、效益协调发展，行业特色鲜明的国家骨干高职院校。